Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms