Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
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VEGFDO43915 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
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VEGFDO43915 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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VEGFDO43915 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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VEGFDO43915 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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VEGFDO43915 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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VEGFDO43915 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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VEGFDO43915 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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VEGFDO43915 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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VEGFDO43915 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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VEGFDO43915 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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VEGFDO43915 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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VEGFDO43915 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VEGFDO43915 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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