Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms