Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB1O43157 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PLXNB1O43157 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PLXNB1O43157 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
PLXNB1O43157 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PLXNB1O43157 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PLXNB1O43157 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PLXNB1O43157 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PLXNB1O43157 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PLXNB1O43157 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PLXNB1O43157 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PLXNB1O43157 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PLXNB1O43157 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PLXNB1O43157 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PLXNB1O43157 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PLXNB1O43157 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PLXNB1O43157 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLXNB1O43157 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLXNB1O43157 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PLXNB1O43157 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLXNB1O43157 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PLXNB1O43157 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PLXNB1O43157 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PLXNB1O43157 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLXNB1O43157 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PLXNB1O43157 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PLXNB1O43157 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PLXNB1O43157 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLXNB1O43157 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PLXNB1O43157 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLXNB1O43157 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PLXNB1O43157 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLXNB1O43157 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PLXNB1O43157 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLXNB1O43157 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PLXNB1O43157 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms