Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms