Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GNPATO15228 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GNPATO15228 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GNPATO15228 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GNPATO15228 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNPATO15228 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNPATO15228 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GNPATO15228 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNPATO15228 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNPATO15228 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNPATO15228 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GNPATO15228 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNPATO15228 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNPATO15228 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNPATO15228 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNPATO15228 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNPATO15228 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNPATO15228 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPATO15228 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPATO15228 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPATO15228 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPATO15228 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPATO15228 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPATO15228 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPATO15228 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPATO15228 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPATO15228 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPATO15228 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPATO15228 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPATO15228 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPATO15228 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPATO15228 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPATO15228 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPATO15228 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPATO15228 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPATO15228 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPATO15228 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPATO15228 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNPATO15228 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNPATO15228 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNPATO15228 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNPATO15228 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNPATO15228 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNPATO15228 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNPATO15228 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNPATO15228 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNPATO15228 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNPATO15228 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GNPATO15228 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNPATO15228 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNPATO15228 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNPATO15228 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNPATO15228 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNPATO15228 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GNPATO15228 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GNPATO15228 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GNPATO15228 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GNPATO15228 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GNPATO15228 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNPATO15228 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GNPATO15228 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNPATO15228 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNPATO15228 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNPATO15228 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNPATO15228 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNPATO15228 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNPATO15228 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GNPATO15228 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNPATO15228 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GNPATO15228 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNPATO15228 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNPATO15228 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNPATO15228 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GNPATO15228 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNPATO15228 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNPATO15228 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GNPATO15228 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNPATO15228 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNPATO15228 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNPATO15228 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNPATO15228 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNPATO15228 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNPATO15228 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNPATO15228 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNPATO15228 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNPATO15228 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNPATO15228 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNPATO15228 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNPATO15228 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNPATO15228 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNPATO15228 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GNPATO15228 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GNPATO15228 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNPATO15228 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNPATO15228 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNPATO15228 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNPATO15228 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GNPATO15228 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNPATO15228 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNPATO15228 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms