Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLGNO14967 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLGNO14967 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLGNO14967 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms