Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASKO14936 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASKO14936 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASKO14936 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASKO14936 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASKO14936 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASKO14936 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASKO14936 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASKO14936 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASKO14936 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASKO14936 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASKO14936 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASKO14936 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASKO14936 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASKO14936 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASKO14936 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASKO14936 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASKO14936 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASKO14936 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASKO14936 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASKO14936 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASKO14936 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASKO14936 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASKO14936 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASKO14936 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASKO14936 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASKO14936 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASKO14936 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASKO14936 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASKO14936 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASKO14936 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASKO14936 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASKO14936 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASKO14936 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASKO14936 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASKO14936 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASKO14936 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASKO14936 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASKO14936 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASKO14936 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASKO14936 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASKO14936 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASKO14936 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASKO14936 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASKO14936 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASKO14936 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms