Protein–RNA interactions for Protein: O14829

PPEF1, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPEF1O14829 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms