Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3AO14802 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3AO14802 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3AO14802 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3AO14802 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3AO14802 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3AO14802 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3AO14802 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3AO14802 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3AO14802 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3AO14802 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3AO14802 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3AO14802 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3AO14802 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3AO14802 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3AO14802 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR3AO14802 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR3AO14802 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR3AO14802 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR3AO14802 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR3AO14802 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR3AO14802 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms