Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2O14595 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
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