Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFKBIEO00221 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms