Protein–RNA interactions for Protein: J3QW42

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QW42 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QW42 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QW42 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QW42 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QW42 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QW42 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QW42 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QW42 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QW42 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QW42 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QW42 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QW42 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QW42 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QW42 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QW42 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QW42 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QW42 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QW42 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QW42 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QW42 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QW42 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QW42 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QW42 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QW42 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QW42 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QW42 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QW42 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QW42 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QW42 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QW42 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QW42 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QW42 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QW42 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QW42 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms