Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C1D1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
H7C1D1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
H7C1D1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C1D1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C1D1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C1D1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C1D1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C1D1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C1D1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C1D1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C1D1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C1D1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C1D1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C1D1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C1D1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C1D1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C1D1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C1D1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C1D1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C1D1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C1D1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C1D1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C1D1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C1D1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C1D1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C1D1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C1D1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C1D1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C1D1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C1D1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C1D1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C1D1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C1D1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C1D1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C1D1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C1D1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C1D1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C1D1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C1D1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1D1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1D1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1D1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1D1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1D1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1D1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1D1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1D1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1D1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1D1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1D1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1D1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1D1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1D1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1D1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1D1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1D1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1D1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1D1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1D1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1D1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1D1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1D1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1D1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C1D1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C1D1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C1D1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C1D1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C1D1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C1D1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C1D1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C1D1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C1D1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C1D1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C1D1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C1D1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C1D1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C1D1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C1D1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C1D1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C1D1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C1D1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C1D1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C1D1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C1D1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C1D1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C1D1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C1D1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C1D1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C1D1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C1D1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C1D1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C1D1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C1D1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C1D1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C1D1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C1D1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C1D1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C1D1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C1D1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms