Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms