Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms