Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms