Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms