Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
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