Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms