Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms