Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms