Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
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