Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms