Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms