Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms