Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP4Q9UKK3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP4Q9UKK3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP4Q9UKK3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP4Q9UKK3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP4Q9UKK3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP4Q9UKK3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP4Q9UKK3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP4Q9UKK3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP4Q9UKK3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP4Q9UKK3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP4Q9UKK3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP4Q9UKK3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms