Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms