Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACL1Q9UJ83 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms