Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms