Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms