Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms