Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXTL2Q9UBQ6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms