Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms