Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms