Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CXXC1Q9P0U4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXXC1Q9P0U4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms