Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms