Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GDAP2Q9NXN4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms