Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms