Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC39A9Q9NUM3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC39A9Q9NUM3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC39A9Q9NUM3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC39A9Q9NUM3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC39A9Q9NUM3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC39A9Q9NUM3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC39A9Q9NUM3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC39A9Q9NUM3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC39A9Q9NUM3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC39A9Q9NUM3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC39A9Q9NUM3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC39A9Q9NUM3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC39A9Q9NUM3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC39A9Q9NUM3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC39A9Q9NUM3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC39A9Q9NUM3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC39A9Q9NUM3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC39A9Q9NUM3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC39A9Q9NUM3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC39A9Q9NUM3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC39A9Q9NUM3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC39A9Q9NUM3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC39A9Q9NUM3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC39A9Q9NUM3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC39A9Q9NUM3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC39A9Q9NUM3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC39A9Q9NUM3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms