Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GINM1Q9NU53 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms