Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms