Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms