Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms