Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms