Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUS3Q9BZE2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms