Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms