Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms