Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms