Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms